品質系統管理為研究發展中不可或缺的一環，有鑑於此，本中心於1998年開始推動ISO國際品保制度，並於1999年成為國內第一家通過ISO 9001國際品保認證之地理資訊系統研究中心，並於 99年2月通過ISO9001：2008年換版認證。為達成更高資訊軟體品質的承諾，本中心積極導入能力成熟度整合模式(CMMI)，整合ANSI/PMI 99-001-2004(PM BOK)國際專案管理標準，於2008年成為國內GIS界第一家取得CMMI認證的單位。秉持著對品質政策的要求，期能提供客戶最優質且專業的服務，本中心實為國內唯一兼具學術理想與實務發展整合能力之研究單位。